硅藻土屬硅質巖類巖石，硅質巖按成因分為兩大類： 生物或生物化學成因—硅藻土、板狀硅藻土、蛋白土、放射蟲巖、海綿巖。 　　

非生物成因（化學、火山作用、次生成因）—碧玉巖、燧石巖、硅華、石英巖。 　　

硅藻土中主要伴生礦物為粘土礦物、炭質(有機質)，當這些礦物含量達50%以上則屬粘土巖、炭質頁巖，在命名時冠以硅藻xx巖。當這些礦物含量小于50%，則屬硅藻土，在命名時冠以xx硅藻土。